Em 1920, chegaram as primeiras famílias, Marcondes, Félix e Vieira dos Santos, oriundas de Santa Catarina e Rio Grande do Sul, atraídas pela madeira em abundância e fertilidade do solo.

Viviam da caça e da criação de suínos, trocados por ferramentas e mantimentos. No ano de 1925, os pioneiros deram inicio à construção da estrada até Chopinzinho e em 1936 foi erguida a primeira capela com missa realizada pelo Frei Timóteo de Palmas.

O Santo Padroeiro da cidade é São João Batista. Com o crescimento do povoado passou a ser Distrito do Município de Mangueirinha em 1954.

No ano seguinte com a emancipação política de Chopinzinho, passou a pertencer a este, como distrito. Em 25 de julho de 1960, pela lei nº- 4.245, alcançou a emancipação político-administrativa.

De acordo com a Contagem Populacional do IBGE, a população de 2009 é de 11.198 habitantes.

Atualmente se destacam as Cooperativas de porte como a Cooperativa Agroindustrial COASUL e a SICREDI Iguaçu, com sedes no Município, e a implantação do Frigorífico de Aves da COASUL.

As principais festas realizadas em São João:

- A Kerb Fest – festa tradicional da comunidade alemã, realizada no mês de abril;

- Festejos alusivos ao Padroeiro São João Batista em junho com a queima da grande Fogueira e a tradicional festa com uma grande churrascada com missa e realizações de bingo e Sarau.

- Festival da Canção Sanjoanens e, realizado no mês de julho; - Torneio Aberto de Xadrez Cidade de São João, realizado no mês de julho;

- Rodeio Crioulo Interestadual, realizado no mês de dezembro.